Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVOPQ8N4V2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms