Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NINQ8N4C6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NINQ8N4C6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms