Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RYBPQ8N488 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms