Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3E9

PLCD3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCD3Q8N3E9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCD3Q8N3E9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PLCD3Q8N3E9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCD3Q8N3E9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms