Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC50Q8IVM0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms