Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC84Q86UT8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC84Q86UT8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC84Q86UT8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms