Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRX1Q86UT6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRX1Q86UT6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRX1Q86UT6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRX1Q86UT6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRX1Q86UT6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRX1Q86UT6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRX1Q86UT6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRX1Q86UT6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRX1Q86UT6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRX1Q86UT6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRX1Q86UT6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRX1Q86UT6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRX1Q86UT6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRX1Q86UT6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRX1Q86UT6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRX1Q86UT6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms