Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7C8

TAF8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF8Q7Z7C8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF8Q7Z7C8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF8Q7Z7C8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms