Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms