Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HS2ST1Q7LGA3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HS2ST1Q7LGA3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms