Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPGS1Q6ZTW0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TPGS1Q6ZTW0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms