Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM43Q6ZSC3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM43Q6ZSC3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBM43Q6ZSC3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM43Q6ZSC3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM43Q6ZSC3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM43Q6ZSC3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM43Q6ZSC3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms