Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS17

RIPOR1, Rho family-interacting cell polarization regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR1Q6ZS17 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RIPOR1Q6ZS17 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPOR1Q6ZS17 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms