Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC129Q6ZRS4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms