Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms