Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYHR1Q6ZMK1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYHR1Q6ZMK1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CYHR1Q6ZMK1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYHR1Q6ZMK1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYHR1Q6ZMK1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYHR1Q6ZMK1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYHR1Q6ZMK1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms