Protein–RNA interactions for Protein: Q6WBX8

RAD9B, Cell cycle checkpoint control protein RAD9B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9BQ6WBX8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD9BQ6WBX8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD9BQ6WBX8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms