Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBR1LQ6UX01 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBR1LQ6UX01 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMBR1LQ6UX01 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms