Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSL2Q6UWE3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms