Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms