Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNCKQ6P2M8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms