Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF6Q6KF10 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF6Q6KF10 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms