Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MCTP1Q6DN14 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms