Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E4F1Q66K89 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms