Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RNF123Q5XPI4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF123Q5XPI4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms