Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT79Q5XKE5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT79Q5XKE5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms