Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT6Q5T7P8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT6Q5T7P8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms