Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM78Q5T7P6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM78Q5T7P6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms