Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECTD3Q5T447 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HECTD3Q5T447 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms