Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL5A1-AS1Q5SY13 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms