Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SAPCD1Q5SSQ6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms