Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIN3Q5JUX0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIN3Q5JUX0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms