Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD55Q3KP44 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms