Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms