Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
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PTPRNQ16849 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRNQ16849 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
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