Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP1R3AQ16821 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP1R3AQ16821 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.6 ms