Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFE2Q16621 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFE2Q16621 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFE2Q16621 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFE2Q16621 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms