Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SGCAQ16586 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCAQ16586 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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