Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CRY1Q16526 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRY1Q16526 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
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