Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USF2Q15853 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USF2Q15853 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USF2Q15853 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USF2Q15853 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF2Q15853 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF2Q15853 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF2Q15853 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF2Q15853 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF2Q15853 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF2Q15853 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF2Q15853 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF2Q15853 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF2Q15853 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF2Q15853 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF2Q15853 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF2Q15853 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF2Q15853 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF2Q15853 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF2Q15853 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF2Q15853 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF2Q15853 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF2Q15853 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF2Q15853 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF2Q15853 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF2Q15853 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF2Q15853 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USF2Q15853 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USF2Q15853 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
USF2Q15853 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF2Q15853 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF2Q15853 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF2Q15853 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF2Q15853 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF2Q15853 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF2Q15853 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF2Q15853 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF2Q15853 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF2Q15853 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF2Q15853 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF2Q15853 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF2Q15853 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF2Q15853 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF2Q15853 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF2Q15853 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF2Q15853 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF2Q15853 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF2Q15853 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF2Q15853 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF2Q15853 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF2Q15853 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF2Q15853 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF2Q15853 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF2Q15853 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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