Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ZNHIT3Q15649 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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