Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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