Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCOLCEQ15113 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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