Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1I3Q14994 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1I3Q14994 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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