Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1CQ14123 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE1CQ14123 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
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