Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CBFBQ13951 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBFBQ13951 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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