Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCINQ13939 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCINQ13939 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCINQ13939 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCINQ13939 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCINQ13939 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCINQ13939 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCINQ13939 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCINQ13939 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCINQ13939 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCINQ13939 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCINQ13939 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCINQ13939 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCINQ13939 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCINQ13939 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCINQ13939 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCINQ13939 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCINQ13939 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCINQ13939 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCINQ13939 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCINQ13939 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCINQ13939 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCINQ13939 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCINQ13939 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCINQ13939 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCINQ13939 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCINQ13939 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCINQ13939 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCINQ13939 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCINQ13939 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCINQ13939 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCINQ13939 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCINQ13939 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCINQ13939 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCINQ13939 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCINQ13939 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCINQ13939 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCINQ13939 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCINQ13939 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCINQ13939 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCINQ13939 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCINQ13939 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCINQ13939 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCINQ13939 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCINQ13939 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCINQ13939 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCINQ13939 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCINQ13939 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCINQ13939 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCINQ13939 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCINQ13939 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCINQ13939 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCINQ13939 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCINQ13939 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCINQ13939 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCINQ13939 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCINQ13939 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCINQ13939 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCINQ13939 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCINQ13939 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCINQ13939 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCINQ13939 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCINQ13939 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCINQ13939 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCINQ13939 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCINQ13939 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCINQ13939 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCINQ13939 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCINQ13939 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCINQ13939 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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