Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKP1Q13835 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
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