Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBA3CQ13748 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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