Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR3Q13615 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTMR3Q13615 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTMR3Q13615 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR3Q13615 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
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